提交人：刘国振
水稻抗体资源库及蛋白质表达数据库的构建
刘国振1*、刘斯奇2、吴琳2、尹长城3、曹英豪12、贾盟1、贾霖1、关明俐1、兰金苹1、侯明明1、王宪云1、魏健1、李晓明1、刘雨萌1、徐文静1、刘钊1、李莉云1、刘丽娟1、窦世娟1、曾祥然1、史佳楠1、范伟1、李雪姣1、牛东东1、缪刘杨1、韦汉福3、潘秦3、赵丽英3、陈浩3、韩宇宁3、郝育杰3、赵磊3、奚文辉3、孔令男3、杨春霞3
1、河北农业大学生命科学学院 保定 071001;
2、中国科学院北京基因组研究所 北京 101318;
3、北京华大蛋白质研发中心有限公司 北京101318 （*E-mail:gzhliu@genomics.org.cn）
摘要
为了深入开展水稻基因功能研究，我们提出了基于抗体的水稻蛋白质组学（Antibody-based Rice Proteomics, AbRP）的策略，其要点在于，建立针对水稻蛋白质的抗体资源库，利用大规模免疫分析技术，揭示水稻蛋白质在不同时空条件下的表达丰度或修饰状态。三年来我们建立了规模化抗体制备的平台和相应的数据库系统（RiceAb），制备了2000多个水稻重要蛋白质的抗体，对水稻根、茎、幼穗、成熟穗、不同发育时期的叶片、非生物逆境胁迫（冷、热、旱、涝、盐）、生物逆境处理（白叶枯病菌）的蛋白质样品开展了大规模免疫印迹分析工作，累计完成5万多个免疫印迹分析，获得了这些蛋白质的表达数据，并着手构建水稻蛋白质表达谱数据库（RiceP）。蛋白质表达谱数据库的建设将为水稻基础和应用研究创建一个重要的支撑平台,与基因组、转录组数据的整合可望进一步丰富水稻乃至植物研究的公共数据资源。
关键词：水稻；蛋白质组学；抗体；免疫印迹；数据库
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