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  提交人:李秋莉

盐生植物辽宁碱蓬转录组测序及分析
曹盈  夏冰  张寅寅  谢瑾卉  李秋莉* 

辽宁师范大学生命科学学院,大连,116081。
*通讯作者:Tel:0411-85827078;E-mail:skyliqiuli@163.com

摘要
   
辽宁碱蓬(Suaeda liaotungensis Kitag)属于藜科(Chenopodiaceae)碱蓬属(Suaeda),生长在渤海湾沿岸盐碱滩上,可以在水质含盐量为3% 的盐土上正常开花结实,是一种耐盐性很强的盐生植物,是一个天然的耐盐基因资源库,是研究植物耐盐机理的好材料。我们对野生条件下生长的辽宁碱蓬进行了全株转录组测序,并对所获得的序列进行了生物学信息分析。经 Solexa 测序,获得reads (>100 bp)39,724,714条;经拼接获得Contigs(>100bp)82,078个;对非冗余蛋白数据库进行 Blastx 比对和功能注释,获得Unigene 17,976个,发现了耐盐相关基因11个,各类转录因子多个,其中NAC类20个,MYB类15个,WRKY类 14个,EREBP类 3个,MYC类2个,DREB类2 个,GT因子2个 。这些数据为研究盐生植物的耐盐机制、获得新的耐盐基因奠定了基础。

关键词:辽宁碱蓬,转录组,耐盐基因,转录因子

主办单位:                    
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